TesTable

Verifica que sus tablas de pasaporte y entrada estén correctamente

Esta herramienta es capaz de detectar cualquier error en sus tablas de entrada, ya sean tablas de pasaporte como tablas de presencias de fuentes externas, datos fenotípicos, genotípicos o de naturaleza de variables fenotípicas.  TesTable ofrece la opción de auto-corrección de los errores que encuentre, lo que no implica que TesTable mejore la calidad de la información analizada, simplemente hace que el formato se ajuste a lo que precisan las demás herramientas CAPFITOGEN.

TesTable detecta los siguientes tipos de error:

  • Campos no procedentes
  • Campos en localizaciones erróneas
  • Celdas vacías
  • Columnas y filas “fantasma”
  • Formatos de fecha errados
  • Formatos de coordenada decimal y sexagesimal errados
  • Códigos específicos del formato de datos de pasaporte FAO-Bioversity 2012 (multi-crop passport descriptor) erróneos

Bajo la opción de auto-corrección, todos los campos donde se encuentran errores son transformados a valores NA (el equivalente para R de “celda vacía”).

En cualquier caso, con o sin la opción de “autocorrección”, TesTable producirá un archivo de texto llamado “TestTableAnalysis.txt” el cual reportará todos los errores encontrados, tanto en Inglés como en Español. Así, el usuario que desee corregir los errores detectados manualmente, puede ir consultando línea a línea este archivo, haciendo los cambios requeridos en su tabla con su programa preferido de hoja de cálculo.

Las tablas a ser analizadas por TesTable deben estar en el mismo formato que para cualquier otra herramienta, es decir, son tablas en formato texto delimitado por tabulaciones (.txt) y deben estar guardadas en la carpeta “Pasaporte”, igual que lo requieren las demás herramientas. En caso de haber seleccionado la función de auto-corrección, la tabla auto-corregida será guardada en la carpeta “Pasaporte”, y dependiendo del tipo de tabla que haya sido analizada, los nombres de las tablas auto-corregidas serán:

Pasaporte:

Pasaporte_Passport_corr.txt

Fuentes Externas:

FuentesExt_ExtSources_corr.txt

Fenotipo:

Fenotipo_Phenotype_corr.txt

Naturaleza de variables fenotípicas:

NaturalezaVariables_VariableType_corr.txt

Genotipo:

Genotipo_Genotype_corr.txt

Finalmente las tablas de pasaporte analizadas con TesTable pueden tener la columna adicional “AVAILAB” requerida por las herramientas ColNucleo o FIGS_R y los cinco campos adicionales que produce GEOQUAL (LOCALQUAL, COORQUAL, SUITQUAL, TOTALQUAL y TOTALQUAL100). Para que TesTable detecte correctamente los errores en tablas de pasaporte con columnas AVAILAB y/o GEOQUAL, por favor indíquelo en las casillas correspondientes de la interfaz de TesTable.

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